Entre los inconvenientes de esta arquitectura se encuentran la degradación de la tasa de extinción y de la SNR debido al ruido ASE. Las figuras de ruido se encuentran en torno a los 7-8 dB. Además se produce distorsión de amplitud y modulación de fase de la señal de salida como consecuencia de la variación de la densidad de portadores y del índice de refracción, lo que conduce a la aparición de jitter en la señal de salida. El dispositivo funciona mejor cuando la conversión se produce hacia longitudes de onda menores.

En la figura 1(b) se muestra también una arquitectura alternativa en donde se evita la utilización del filtro óptico a la salida, resultando un dispositivo más simple y barato. En este caso las señales viajan a través del SOA en sentidos opuestos. Dado que no existe filtro, la longitud de onda de salida puede sintonizarse y además es posible incluso convertir a la misma longitud de onda. Sus principales inconvenientes son que se encuentra limitada en velocidad debido al tiempo de tránsito de las señales y la señal convertida sufre bastante jitter.